La volonté de l’Afrique de freiner la propagation du COVID-19 dépend de plusieurs facteurs. Jusqu’à présent, l’accent a été mis sur la faiblesse du système de santé en Afrique. Cependant, l’expertise scientifique croissante de la région en virologie, en génomique et en collaboration intersectorielle pour mener des recherches pouvant servir de base aux politiques de confinement est tout aussi importante. Et ils sont largement ignorés.
Le monde se concentre sur le développement de diagnostics, de vaccins et de médicaments pour COVID-19. Dans ce cas, il est important de vérifier dans quelle mesure les scientifiques et les institutions africains se préparent aux essais cliniques de vaccins et de médicaments.
Un travail révolutionnaire est déjà en cours. Par rapport à l’épidémie d’Ebola en Afrique de l’Ouest depuis 2013, l’Afrique est prête pour la recherche sur les infections émergentes sur le continent et dans chaque pays.
Un exemple est la création du Centre africain de contrôle des maladies. Il a été créé par l’Union africaine en 2016 après le déclenchement de l’épidémie d’Ebola en Afrique de l’Ouest. Il s’agit d’une agence technique spécialisée qui soutient les plans de santé publique des États membres. Il vise également à renforcer les capacités des institutions et des partenariats de santé publique africains. L’objectif est de faire en sorte que les pays africains puissent détecter et répondre rapidement et efficacement aux maladies sur la base d’interventions et de plans basés sur les données.
De nombreux pays sont également mieux équipés pour effectuer des recherches innovantes.
Des percées importantes
Moins d’une semaine après le premier cas confirmé de COVID-19 au Nigéria, des scientifiques locaux ont signalé la première séquence génomique du SRAS-CoV-2 en provenance d’Afrique. La séquence a été immédiatement mise à la disposition de la communauté scientifique mondiale.
Le 1er mars 2020, le premier spécimen COVID-19 du Nigeria a été envoyé aux deux meilleures institutions de recherche du Nigeria. Il s’agit du Centre d’excellence en génomique africaine des maladies infectieuses de l’Université Saviour et du Centre de virologie humaine et de génomique de l’Institut nigérian de séquençage et de médecine des caractéristiques moléculaires.
Le délai d’exécution entre la réception de l’échantillon et la génération de la séquence est de trois jours. L’analyse du cluster du génome est cohérente avec les antécédents de voyage des personnes infectées qui sont entrées au Nigeria en provenance d’Europe. Le traitement des échantillons et l’analyse des données sont le résultat de la coopération entre plusieurs agences locales. Les partenaires en dehors de l’Afrique n’ont fourni qu’un soutien limité.
La création de nombreux instituts nationaux de santé publique, avec le soutien du Centre africain de contrôle et de prévention des maladies , a créé l’environnement régional pour les travaux de génomique à effectuer à grande échelle à l’aide d’équipements à haut débit.
Cette percée a montré que le Nigéria a un haut niveau de compétence technique, de vitesse de traitement, de rigueur scientifique et d’ouverture.
Dans un autre exemple encore, des chercheurs sud-africains ont récemment signalé le séquençage du génome d’un échantillon local de SARS-COV-2 . Le séquençage du SARS-CoV-2 a été effectué en Chine, aux États-Unis et en Europe pour déterminer l’identité de la souche locale du virus.
Les études de séquençage sont importantes pour détecter de nouvelles formes de virus en cas de mutations. Ceci est essentiel pour la surveillance afin de déterminer la propagation du virus. Les données générées par les études génomiques éclairent également le développement de vaccins.
De nombreux pays d’Afrique, dont le Nigéria, le Kenya et l’Afrique du Sud possèdent désormais des laboratoires nationaux de niveau de biosécurité 3 pour travailler avec des virus et d’autres agents pathogènes hautement infectieux. Le Gabon et l’Afrique du Sud ont des laboratoires de niveau de biosécurité 4.
Ces développements marquent un changement significatif au cours des sept dernières années. Par exemple, au début de l’épidémie d’Ebola en Afrique de l’Ouest, presque toutes les séquences du génome ont été réalisées en dehors de l’Afrique. Les scientifiques africains ont travaillé comme participants secondaires. Et avant l’épidémie d’Ebola en Sierra Leone en 2014, aucune installation nationale n’était équipée pour effectuer les tests moléculaires nécessaires au diagnostic des infections virales.
Mais en 2016, des laboratoires avaient été créés pour effectuer le séquençage du génome localement. De nombreux virologues et épidémiologistes peuvent désormais collaborer avec des biologistes moléculaires qualifiés et équipés.
Initiatives panafricaines
Les Centres Africains de Contrôle des Maladies dirigent les efforts régionaux dans la recherche et la gestion du COVID-19 sur le continent. En outre, le Forum africain de réglementation des vaccins au Bureau régional de l’Organisation mondiale de la santé aide les pays à auditer les propositions d’essais cliniques pour les vaccins et les médicaments. L’objectif est de protéger la propriété intellectuelle du continent.
Au niveau national, la recherche virologique et génomique menée au Nigeria en mars 2020 a été coordonnée par les centres nigérians de contrôle des maladies.
Pour sa part, le South African Medical Research Council a récemment créé un centre de génomique pour permettre un séquençage abordable du génome entier en Afrique afin de faciliter l’innovation en santé.
Compte tenu de la gravité de la menace COVID-19, les pays offrent un financement pour la recherche sur le continent. Par exemple, le Partenariat des pays européens et en développement sur les essais cliniques a lancé un appel à propositions pour soutenir les activités de recherche en Afrique subsaharienne afin de gérer et de prévenir la propagation du COVID-19. Le partenariat est financé par l’Union européenne. Le budget de l’appel de 4,75 millions d’euros comprend un financement du Département sud-africain des sciences et de l’innovation.
Espérons que cela encouragera d’autres pays africains à engager des fonds pour la recherche sur le COVID-19 en Afrique.
Mots clés : Afrique, Actualités, Economie, Santé publique, Coronavirus, Science et innovation pour le développement, Covid-19, SARS-CoV-2
Rédaction
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